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La Maestría en Género (MG) cuenta con dos énfasis de trabajo de grado: investigación y profundización, que definen el tipo de competencias a desarrollar:

En el énfasis de investigación: el desarrollo de competencias que permitan la participación activa en procesos de investigación y análisis a través de una formación teórica sólida, un acercamiento a distintos métodos de investigación y el desarrollo de un pensamiento crítico e interdisciplinario que permita la aplicación de estas herramientas en su trabajo como docentes, investigadores, asesores y analistas, líderes de opinión, profesionales en consultorías u organismos multilaterales.

En el énfasis en profundización: el desarrollo de competencias para el análisis de políticas y programas desarrollados desde la perspectiva del género, a través de la formación interdisciplinaria. Este énfasis está dirigido a profesionales de distintas disciplinas que por su desempeño profesional están interesados en ampliar su conocimiento sobre algún tema desde la perspectiva de género, con el fin de adquirir competencias y herramientas que les permitan contribuir y aplicar dicha perspectiva en su quehacer profesional, tales como funcionarios de entidades públicas nacionales o locales, profesionales vinculados a programas y proyectos de ONG, técnicos de organismos de cooperación nacional o internacional, artistas de organizaciones culturales, profesionales de asociaciones o gremios empresariales, etc.